Есть возможность использовать пользовательский источник обновления. Для этого необходим файл в корневой папке config с именем version.php. В поставку он включен под именем version_example.php. Его необходимо переименовать в version.php.
В папку userfiles/local_storage складываем необходимые обновления полученные с официального сайта. Корректируем файл distr.info . Аналогично переименовав его(в первый раз) из distr_example.info В этом файле меняем номер ревизии на текущий в обновлении. после этих манипуляций запускаем штатный механизм обновления. Система пройдет по локально указанному пути и выполнит необходимые процедуры в штатном режиме.
Это, например, можег потребоваться когда надо произвести какие то манипуляции с архивом (что-то исключить или наоборот добавить в полученный архив апдейта с официального сайта.)